BioBlender عبارة عن حزمة برامج مبنية على برنامج النمذجة ثلاثية الأبعاد مفتوح المصدر.علم الأحياء يعمل في مقياس النانو ، مع أشياء غير مرئية للعين البشرية.مع BioBlender ، من الممكن إظهار بعض الشخصيات التي تملأ خلايانا ، بناءً على البيانات العلمية وأعلى مستوى للمعالجة ثلاثية الأبعاد.يدرس العلماء في جميع أنحاء العالم البروتينات على المستوى الذري ويقومون بإيداع المعلومات في مستودع البيانات البروتيني العام ، حيث يتم وصف كل جزيء كقائمة من ذراتها وإحداثياتها ثلاثية الأبعاد .... مع مستخدمي BioBlender يمكنهم التعامل مع البروتينات في الفضاء ثلاثي الأبعاد، عرض سطحها بطريقة واقعية ، ووضع حركات البروتين على أساس المطابقة المعروفة.يمكن تحميل ملفات PDB من دليل المعرفة من قبل المستخدم أو تحميلها مباشرة من موقع PDB (عن طريق إدخال رمز PDB).يتم عرض البروتين في شكل ثلاثي الأبعاد (كذرات أو سطح جزيئي) ويمكن للمستخدم حساب وتصور خواصه السطحية ، إمكانات جزيئية محبة للدهون ، إمكانات كهروستاتيكية.بالنسبة لحركة البروتين ، يقوم BioBlender بحساب الوسطيات بين اثنين من المطابقات باستخدام Blender Game Engine.يعطي البرنامج كإخراج ملفات PDB الوسيطة والصور المقدمة كفيلم.BioBlender هو تطبيق Blender ، وهو برنامج مفتوح المصدر ، وموزع مجانًا ، ومتعدد المنصات ، قابل للتشغيل البيني ومدعوم للرسوم المتحركة ثلاثية الأبعاد ، والمؤثرات البصرية وألعاب الفيديو.إن الجمع بين رسومات الكمبيوتر ثلاثية الأبعاد ومحرك الألعاب والبرامج العلمية ، يجعل BioBlender أداة كاملة لتوضيح حركة البروتينات وعرض ميزات سطحها باستخدام رمز مرئي يعتمد على التركيب والتأثيرات الخاصة للجسيمات.بهذه الطريقة ، يمكن إظهار الخواص الفيزيائية والكيميائية للجزيء المتحرك.BioBlender هو نتيجة للتعاون ، بقيادة مجموعة SciVis في CNR في بيزا (إيطاليا) ، بين علماء من مختلف التخصصات (البيولوجيا والكيمياء والفيزياء وعلوم الكمبيوتر)